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HEATag:单细胞测序样本标记新方法,低成本、跨物种、全平台兼容!

发布时间:2025-11-10

单细胞测序技术正在革命性地推动我们对生命复杂性的认知,然而其高昂的每样本成本和技术复杂性,限制了其在更多实验室和更广泛物种中的普及。尽管多重样本标记技术能有效“降本增效”,但现有的方法往往受限于抵抗能力植物物种特女性朋友、寡核苷酸淡化料工费慷慨激昂或实际操作方法有难度。近日,南方海洋科学与工程广东实验室(广州)的陈凯教学公司在Journal of Genetics and Genomics上发表了一项创新性方法学研究,提出了一种名为HEATag的新型样本标记策略,为我们提供了一个成本低投入、跨种群、全游戏平台兼容的全新解决方案。

杂志期刊介简

Journal of Genetics and Genomics (JGG)是由中华物理院校基因与發育怪物学学习所和中华基因直到学会牵头的知名学术讨论讨论论文杂志学术刊物,始终坚持打造于媒体报道健康物理学和临床医学基因学区域的原创设计性学习工作成效。JGG 2028年度会影响细胞因子7.1,Scopus学术讨论讨论论文杂志学术刊物评测因素CiteScore 9.9,位居JCR 2028年度GENETICS & HEREDITY区域Q1区(Top 10%),BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY区域Q1区,位居中华物理院校论文杂志学术刊物系统分区怪物学专业类别1区(Top论文杂志学术刊物),基因学和血生化与原子怪物学小类双1区。

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什么样是HEATag

比较巧妙的“二合为一体”设汁

HEATag是由凝集素和HUH内切酶具有的相融合淀粉酶

「市场定位器」模组 - 凝集素

能够识别细胞膜上广泛存在且高度保守的糖基化表达(如GlcNAc和Neu5Ac)。

「连接方式器」版块 - HUH内切酶

可以序列特异性地与普通的、无需化学修饰的单链DNA(ssDNA)目录长条形码查询做共价相连。

“1+1>2”的视觉效果:将两者融合,得到的HEATag蛋白既能通过凝集素牢牢锚定在细胞膜上,又能通过HUH蛋白携带特定的DNA条形码进行样板标识与溯源系统。

Fig1: HEATag诸多标上方法提示图

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实操检定

HEATag倒底有点能打?

能够 在不一水平下,推动喂母乳生物组织核系单组织核混样测序

实验室里的设计再精妙,也要经过真实样本的 “实战考验” 才算数。调查专业团体为 HEATag 设有了多轮 “学习压力各种测试”,从受损癌细胞系到受损癌细胞质,从室温到低温制冷的效果,从新鲜样板到固定不动样板,全方向手机验证它的不稳性和可以信赖性。

1轮测量面向喂母乳生物人体内部系:实验员工决定了是来自于人、鼠、仓鼠这三个动物群的七种人体内部(HEK293T、K562、MEF、CHO),在温度下能 HEATag 标出后相混测序。决定回收分类处理的 11447 个人体内部中,85.66% 都能借助 HEATag 方形码准确性配比到原动物群,样例间交差环境污染非常少,UMAP 聚类算法介绍更加是单独关系证明,HEATag 方形码与动物群特喜欢的人染色体组基本特征程度一样。 完后,测评前提生活具体条件进一歩在线升级:科研人数试试在 4℃下标注新鲜感松茸体内部、在常温下标注甲醇规定体内部,甚至于真接标注体内部核。结杲依旧出众:各个前提生活具体条件下,模本标签贴与动物群个人信息均具备好的涉及到性,拆成更错误率超 95%。就算甲醇规定会以至于轻度的转录本交叉的情况的污染,体内部核制作就会极少量 RNA 人才流失,体内部业务类型的参考文献标注结杲依旧与新鲜感松茸模本保持着相一致,声明书 HEATag 能否标注有所不同处置前提生活具体条件下的实验操作模本。

Fig2: HEATag 可在不同于状态下达成单生殖细胞转录组混样了解

要标记符号乳期部分植物和海上无脊梁骨部分植物的原代神经细胞

如何说受损肿瘤细胞系测式是 “地基题”,那机构样表即是 “浮动题”, 一些样表之所以因受损肿瘤细胞的类型比较复杂、环镜自我调节性特别的,变成 标上技术水平的 “疑难问题”,而 HEATag 恰巧在一些 “疑难问题” 上塑造了强势。

研究团队选择了大鼠和小鼠的睾丸组织性,这类样本包含精原干细胞、精母细胞、精子细胞等多种类型,对标记一致性的要求极高。实验中,两种动物的睾丸用特异性 HEATag 条形码标记后混合测序,最终获得的 14663 个细胞这样不仅能被精确性分辩,其它最主要细胞核内型的聚类分析可是都精准可辨。

更令人惊喜的是HEATag对海上微生物的更换性。HEATag能在海水的等渗溶液中标记新鲜的海洋动物细胞(如海月水母、大西洋海刺水母)。研究人员用人工海水稀释的HEATag 标记了水母和珊瑚的组织细胞后在 BD Rhapsody 平台测序,最终回收的 6452 个细胞中,HEATag 方形码与鱼类转录组更具较高完整性性,也没有显现因高盐场景致使的 “标识丧失”。后续对甲醇固定的海洋生物细胞测试结果显示,HEATag 在固定样本中的拆分效果优于新鲜样本。

Fig3: HEATag 可改变哺乳期宠物集体样版多大 scRNA-seq 数据分析

Fig4: HEATag可保持生鲜深海无脊柱动植物多沉 scRNA-seq 剖析

HEATag与肿瘤细胞的运用并不会促使转录组的相关性变更

对样本标记技术来说,“不影响样本本身的 RNA 特征” 是底线。研究团队将来自同一供体的等量的 HEATag 标记细胞与未标记细胞混合测序,对比两者的 RNA 质量、基因捕获数量和细胞组成。结果显示,标记组与未标记组的 RNA 质量没有明显差异,捕获的基因数量基本持平,UMAP 图谱显示两组样本的细胞组成高度相似,转录相似性更是维持在高位。无论是细胞簇的注释结果,还是不同细胞类型的基因回收数量,两组都几乎一致,没有出现 “标记导致的基因表达异常”。这意味着,HEATag在达成标志级任务的一起,会对随后的转录多组分析带来不干扰,以确保了论述数据源的真实度性。

Fig5: HEATag不是影晌模本的 RNA 体现模式英文

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未来是什么可期

HEATag 能为单上皮细胞探讨引来一些 ?

HEATag 的作用,远不至于 “应对记号状况”,它的灵生物高性和共通性,也在为单内部研究探讨拉开大量或许性

从应用软件场景应用了解

HEATag 能涉及从 “单纯特别分析一下”(如癌组建与正常情况组建、用药净化处理与相较比较)到 “大占比教学科研”(如组建神经细胞膜图谱绘图、高通芯片量建立)的全标准供需。现在 PIP-seq、Stereo-cell 等复合型可初始化技術的的发展,HEATag 还能进一部提高自己单神经细胞膜教学科研的通量,力助教学科研团对做最大占比的建设项目。

从跨范围竞争力来了解

HEATag 不单适用以于转录组学,还能与表观表观遗传组学、球蛋白组学、范围组学等的新技术结合在一起,顺利通过个性检索和寡核苷酸队列,HEATag 就能够更好加入不一样的的组学程序流程,不影向数据获取广度。也,应用场景HEATag还就能够不断发展单神经细胞糖组学研究分析的新技术。

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的合作动态性

拜谱菌物与陈凯教学制定目标系统化公司合作有意愿

指的关注度的是,在 HEATag 技術能够出惊人用途能力的的背景下,拜谱微生物体技术已与男方大海科学有效与公程福建实验性报告室(成都)陈凯院士完成率最初始合作协议有意向。当事人打算致力于 HEATag 技術的服务业化支撑、科技开发流量转化等导向发展深层协调,推动了这种低人工成本、跨植物物种的单内部标签技術快些用途于现实情况科技开发场景设计,为越多实验性报告室提拱极有效率、经济社会的单内部设计专用工具,力助科技开发上班者在内部微生物体技术学、大海微生物体技术学、疾患工作机制等范畴提供越多进阶
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