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首页 > 拜谱生物 > 干货分享 > 网路药理学学证明草酸钙肾结石钝化应激反应和发炎直接损伤共识机制

网络药理学揭示草酸钙肾结石氧化应激和炎症损伤机制

发布时间:2024-08-02
草酸钙(CaOx)肾结石是泌尿系統化最应见的肠子疾病中之一。肾组识中CaOx晶状体过趋于稳定累积会会造成肾小管血细胞破损和凋亡,于是会造成肾结石的养成。短链蛋白质细胞酸由肠子内好氧菌沙门氏菌堆肥饮食营养玻纤所产生,不只是在产品局部肠子防御系統中切实充分调动能力,特别在系統化技术上也切实充分调动根本能力。各举,丁酸是最大量的短链蛋白质细胞酸,具备消除炎症和免疫性促使能力,本探究浅议丁酸对CaOx肾结石的能力极其潜在性靶点。

围绕草酸钙肾结石相关机制研究,华山医院科室泌尿整形科吴忠硕士生生导师、周子健硕士生于今年5月在Chem Biol Interact发表了相关成果,7月4日该团队又有一篇新作发表。吴忠教援、周子健博后在Food and Chemical Toxicology(IF=4.3)上发表题为“Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9”的研究文章。研究人员发现丁酸在体外和体内均能抑制CaOx肾结石模型的氧化应激和炎症损伤,并利用网络药理学预测发现CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的靶基因,最后通过细胞实验证实CYP2C9在草酸诱导的HK-2细胞损伤模型中的作用。拜谱生物技术与吴忠教授、周子健博士团队再次合作,提供了无线网络药剂学学服务培训,助力预测CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的潜在靶点,为丁酸预防CaOx肾结石产生的临床应用奠定理论基础。

软文称谓:Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9(Food Chem Toxicol.,IF=4.3,2023.07) 潜在客户行业:华山青岛博士整形医院医院 理论研究人群:大鼠、HK-2细胞系 分组名图片信息:剖析组(Con)、建模方法组(Model)和丁酸钠组(NaB) 拜谱可以提供系统:网咯药理学学探测

总体目标过程图

学习结论

的实验人工先引入大鼠实体模板工具,顺利通过生理问题血生化指数公式和团队病理学学复染等的实验的手段知道丁酸就能够减低CaOx实体模板工具大鼠肾CaOx硫化锌的变成和问题,改善CaOx实体模板工具大鼠的支原体感染问题和空气腐蚀杂质的过头抒发。还有,丁酸还可遏制草酸帮助的HK-2组织问题、空气腐蚀应激性和组织凋亡。 为理论研究丁酸结构特征类型和靶dna网路,理论研究工人从PubChem修改丁酸和丁酸酯的二维和三维图结构特征类型(图1A)。可以通过PharmMapper的的数据显示库和Uniprot的的数据显示库正确处理后共建立出113个丁酸靶dna供进一点概述。将dna所有接入STRING的的数据显示库,通过PPI网路概述。Cytoscape总结出了重新排列的前20的核心区靶dna的具体网路图,包扩CYP2C9、CASP3、MAPK14、ALB、HRAS、ABL、RARA、RARG、RXRB、PRKACA、NOS3、SRC、MMP9、KDR、HSP90AA1、HPGDS、GSTA3、GSTA1、GSR和GSTM2(图1B)。那些核心区dna与网路中的别的dna均特征出很大的一些性,证明那些dna机会性充分充分调动着联合的意义。GO和KEGG概述反映了丁酸核心区dna的一些路线和生物学制品学特点(图1C)。核心区dna最主要的与类固醇刺抗生素回复、脱色的影响应激症状性回复、活力酶氧内部对类固醇刺抗生素影响的的影响以其对呈酸性生物学学元素的的影响密切相关。上述讲到经验,那些核心区dna最主要的直接参与了脱色的影响应激症状性和对活力酶氧的生物学制品的影响操作过程,是肾结石组成系统中首要的的路线,这表述丁酸机会性在肾结石中充分充分调动为重要的的意义。

图1| 丁酸设计与靶基因组网讲解(图源:Zijian Zhou., et al., Food Chem Toxicol.

为进一个步骤探险丁酸对CaOx肾结石真是切靶人类DNA组遗传遗传,探索人士利于GEO信息资料库对GSE73680中身体健康照表与CaOx肾结石人群的人类DNA组遗传遗传距离完成了探索。照表组与CaOx结石人群的强势性距离表示人类DNA组遗传遗传(DEGs)挑选规格为P < 0.05、|log2(FC)| > 1。共挑选到3783个人类DNA组遗传遗传来强势變化,在这其中3379个(89.4%)人类DNA组遗传遗传表示上浮,404个(10.6%)人类DNA组遗传遗传表示调低(图2A)。对DEGs完成聚类算法讲解法讲解,热图提示了前10个被选中DEGs的二维逐层聚类算法讲解法基本特征(图2B)。之后,探索人士利用GeneCards信息资料库劳动力签定了370个可能会与CaOx肾结石关于的人类DNA组遗传遗传,斩获前20位的预测分析人类DNA组遗传遗传试述关于性评判如同2C一样。重点在于寻得丁酸控制CaOx肾结石的重点靶点,探索人士将PharmMapper中的丁酸靶点、GEO中的DEGs和GeneCards中的CaOx肾结石关于人类DNA组遗传遗传加工得出新一个Venn图。最中,CYP2C9被明确为丁酸影向CaOx肾结石的风险靶点(图2D)。显然,探索人士还完成了丁酸与CYP2C9的团伙联结,CYP2C9的多个氨基残基ASN-474、LYS-48和GLY-46与丁酸之间角色,氢键能为4.2 kcal/mol(图2E)。 在凭借系统药理学学预估CYP2C9是丁酸干扰CaOx肾结石的靶基因组后,钻研的人员还经由体细胞核实验英文表明了CYP2C9可削减草酸分析的HK-2体细胞核的ROS总体水平、发炎受损和凋亡。

图2| 部分据库合力数据分析预侧CYP2C9是丁酸用途于CaOx肾结石的靶基因遗传

调查毕竟

本研究分析第一个发展丁酸在身体和内部均能遏制作用CaOx肾结石对模型的硫化应激性状态和感染决定,自后用在线药学学选择得以丁酸决定CaOx肾结石的内在的靶点——CYP2C9,最后一个用神经组织细胞科学实验验证CYP2C9在草酸盐成脂的HK-2神经组织细胞ROS级别、感染决定和凋亡。这类发展反映出丁酸已经用遏制作用CYP2C9来遏制作用CaOx肾结石的硫化应激性状态,缓减感染决定。这一项流程中拜谱怪物技艺水平提供数据了在线药学学技艺水平工作培训,再者拜谱怪物技艺水平可从而提高完美建立完善的基因组组学、蛋清质组学、消化吸收组学等多个学商品及技艺水平工作培训,欢迎词拨打电话顾问! 考虑文献综述:Zhou Z, Zhou X, Zhang Y, Yang Y, Wang L, Wu Z. Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9. Food Chem Toxicol. 2023 Aug. doi: 10.1016/j.fct.2023.113925.
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