
近日,南京市医科高中弟一附屬医院专家王学浩院土开发团队在Cancer Letters上发表了“O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma”的研究论文。该研究建立了一个涉及YBX1糖酵解和H3K18乳酸化的正反馈循环,从而加速了HCC的进展。破坏这种反馈循环可能为HCC提供一种新的治疗策略。拜谱生物为该研究提供了转录组测序,蛋清互作组和靶点动能排泄检测分析服务。
英文字母网站标题:O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma(Cancer Letters IF:10.1)
简体中文标题文字:YBX1的O-乙酰葡糖胺化修饰驱动肝细胞癌中糖酵解-组蛋白乳酸化反馈环路
企业厂家:南京医科大学
的研究建材:细胞
拜谱提供数据业务:转录组测序+蛋白酶互作组+靶向疗法动能排泄组
技艺自驾线路:
科学研究成果
01、YBX1被鉴别为HCC中糖酵解的关键因素什么是基因
本论述抓取HCC淋巴恶性良性肿癌样品(n=7)的单恶性良性肿癌组织细胞系RNA测序统计数据显示集来进行浅析,发觉糖酵解亲水性重要一起在淋巴恶性良性肿癌恶性良性肿癌组织细胞系中,hdWGCNA浅析识别系统出9个人类基因引擎(图1A-G)。TCGA-LIHC序列的活浅析来确定YBX1为独立性活风险控制各种因素(图1H)。进三步切合IHC、WB实验性和淋巴恶性良性肿癌集体结构与相临非淋巴恶性良性肿癌集体结构的个人空间转录组学统计数据显示集声明YBX1是肝恶性良性肿癌组织细胞系癌治疗方法的隐性靶点(图1I-K)。
图1:YBX1被确定好为设定HCC细胞系糖酵解的首要客观因素
02、YBX1促使HCC中的有氧糖酵解和繁衍
为了研究YBX1在调控HCC糖酵解中的作用。构建YBX1敲低细胞系,靶点势能新陈代谢组学检测,敲低后糖酵解途径的几个关键中间体显著减少,三羧酸(TCA)循环中间体的水平也降低了(图2A-D);结合葡萄糖碳示踪法、细胞外酸化率检测等实验证实YBX1敲低后,糖酵解活性受损,葡萄糖摄取和乳酸分泌减少,抑制HCC细胞增殖(图2E-K)。
图2:YBX1力促HCC中的有氧糖酵解和繁殖
03、OGT与YBX1配合并有助于YBX1的O-GlcNAc糖基化
为了识别YBX1的调控因子,蛋清互作组分析显示YBX1与O-GlcNAc转移酶(OGT)相互作用,并结合Co-IP和共定位进行验证(图3A–E)。进一步创建了一个OGT K908A突变体,利用O-GlcNAc糖基化激活剂、抑制剂OSMI-1判断YBX1的O-GlcNAc糖基化的变化(图3F-H),结构域分析OGT的TPR结构域对于与YBX1的结合至关重要(图3I-L)。免疫沉淀YBX1的质谱分析揭示了六个潜在的O-GlcNAc糖基化位点,并结合点突变和分析证实T57是YBX1上关键的O-GlcNAc糖基化位点(图3M-O)。
图3:OGT与YBX1根据并加速YBX1的O-GlcNAc糖基化
04、YBX1的O-GlcNAc糖基化促进会其磷碱化,而促进会其核转位
进几步检查测量YBX1的O-GlcNAc糖基化有无影响到其磷过酸,在OGT敲低的HCC上皮神经细胞中或用OGT促使剂OSMI-1清理,YBX1球球球蛋白标准面差异性减小,YBX1磷过酸差异性减掉(图4A-C)。IP实验设计提示 ,在类似的Flag-YBX1底物标准面下,YBX1-WT的磷过酸标准面差异性大于YBX1-T57A,得出结论磷过酸的延长不光仅是这是由于更大的YBX1球球球蛋白形容(图4D)。剥离 了核和质混合物知道TMG清理的HCC上皮神经细胞中YBX1核形容的增大(图4E-F),进几步知道YBX1磷过酸的关键的调节器成分是AKT(图4G-I)。这知道推崇O-GlcNAc糖基化完成加快会其磷过酸来增加YBX1球球球蛋白平稳性并加快会核转位。
图 4.YBX1的 O-GlcNAc 呈现有助进于其进步骤会出现磷过酸呈现并能够增强其核转位
05、YBX1有利于促进PKM2转录
前期结果表明YBX1 O-GlcNAc糖基化通过增强糖酵解和细胞增殖促进HCC进展。为了研究YBX1如何调控糖酵解,我们在HCC细胞中进行了转录组测序分析,糖酵解相关基因集在YBX1敲低细胞中显著抑制(图5A-B)。RNA 测序数据和 CUT&Tag 数据集以及ChIP-qPCR、QRT-PCR 分析表明PKM2 和 LDHA 是 YBX1 的直接转录靶标(图5C-H)。
图 5.YBX1促进会PKM2转录
06、YBX1 就能够从而提高组蛋清乳碱化表达含量
研究方案发现YBX1敲低相关性下调淀粉酶酶质乳硝化做用,更是是H3K18乳硝化做用(图6A-C)。糖酵解抑止剂2-DG的实践印证了糖酵解与组淀粉酶酶乳硝化做用的立即相互影响,抑止糖酵解可相关性下调H3K18la情况(图6D)。PKM2过抒发可逆转转YBX1敲低形成的H3K18la下调,之外源乳酸净化处理这不仅提升自己H3K18la,还引发YBX1抒发调涨,显示信息普遍存在正在向回馈(图6E-G)。CUT&Tag与ChIP-PCR印证,H3K18la实现生物富集于YBX1启动的子立即驱动其转录,该的过程受O-GlcNAc糖基化调节作用(图6H-J),高并发现P300 调涨是YBX1激发H3K18乳酰化做用的措施(图6K-L)。
图6.YBX1增强学习H3K18乳碱化掩盖平行
本文个人心得体会
在一项科研中媒体报道了YBX1在HCC中高表明,并与糖酵揭秘切有关。YBX1在T57处被O-GlcNAc呈现,最终得以不稳定性蛋清质并扩大其表明。一种呈现还带动YBX1在T57处的磷硝化作用,带动其核易位。由于,一种整个过程增強了糖酵解有关人类基因组的转录并激起乳酸的导致。于此,YBX1激话P300的转录,转而win7驱动组蛋清的乳硝化作用,越来越是H3K18la,H3K18乳硝化作用正向着管控YBX1人类基因组转录(图7)。
图7.Y糖酵解-表观显性基因双面馈环逻辑图
拜谱个人心得体会
本研究结合了单细胞转录组、空间转录组的数据,利用转录组、蛋白互作组、代谢组以及多种分子实验揭示了一个YBX1-糖酵解-H3K18la 的反馈回路,驱动HCC进展,并提示针对HCC代谢的潜在治疗策略。拜谱菌物为该研究提供了转录组测序,球蛋白互作组和靶点热量分泌组技术服务,拜谱生物技术建立了完善成熟的转录组学、蛋白酶组学、泰语翻译后装饰组学、消化吸收组学以及多组学联合产品技术服务体系,助力发表高分文献,欢迎致电咨询!
对比论文文献综述
Ji Y, Xu Z, Tang L, Huang T, et,al.. O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma. Cancer Lett. 2025 Oct 28;631:217957. doi: 10.1016/j.canlet.2025.217957. Epub 2025 Jul 26. PMID: 40721081.