
2023年9月26日,宁夏大学刘敦华教授团队在Food Chemistry(IF=8.8)上发表题为“TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration”的研究文章。研究人员利用TMT定量蛋白质组学共鉴定出377个差异表达蛋白(DEPs)。转铁蛋白、铁蛋白、谷胱甘肽过氧化物酶(GPX) 4和血红素加氧酶1等15种DEPs参与脂质过氧化、Fe2+ 和Fe3+ 转化、铁离子积累和线粒体氧化应激诱导铁死亡。此外,化学致癌物ROS、谷胱甘肽代谢、HIF-1和PPAR等信号通路可能通过影响游离铁过载和GPX4失活来促进铁凋亡。该研究成果中 拜谱生态学 为其提供 TMT核蛋白组学 的检测与分析,发现的差异蛋白有助于拓展屠宰后牛肉储存过程中铁死亡的生理和分子机制的认识。
PART 01
设计结果显示
学习工作人员研究性学习近年来要在冷冻箱室保存精力提升了牛羊肉的强度、持混流式水轮机、色调、散布铁含磷量、ROS、脂质过氧化反应物、MDA、GSH和GPX4层次来考核力量组织安排上皮细胞系的铁死亡者情况。结论出现,要在冷冻箱室保存精力提升了后,牛羊肉的强度在第5天和第6天相关性减少;持水专业能力大大减少;颜色图片变深,失去了色泽,鲜灰色调成暗灰色。前者,散布铁、化学活化氧和MDA的含磷量相关性增大,上皮细胞系凋亡率相关性变高。 研究分折相关人员提现区别冰箱时间间隔的背部肌供试品的膳食纤维质,并且来SDS-PAGE分折,膳食纤维质条带在区别时间段地域分布平滑且同类(图1a)。依据膳食纤维在区别供试品中的表示情形,分折显示一致组供试品的中个数相当于一致水平面(图1b),详细说明背部肌供试品膳食纤维质更具优质的组内同类性和组间之间的关系性。 血清酶质组学共认定出1996种血清酶质。以B0为剖析组,需求B1、B2、B4和B6中的血清酶开展性别差别理解爱阐述,共认定到37几个DEPs。将火山图数据可视化,并有差别 FC > 1.2、FC < 0.86和P < 0.05这两个标准的阐述DEP。然而如图理解1c-f理解,在B1/B0、B2/B0、B4/ B0和B6/B0中分刘海别认定出22、33、73和140个DEPs,但其中分刘海别调涨6、11、32和85个,下降16、22、41和56个。聚类分析技巧估评了有差别 要在冷藏室保存第一阶段健身肌肉群组识中血清酶质的理解爱,然而显示信息健身肌肉群血清酶理解爱性别差别近年来储藏时候的增长而增长(图1g)。
图1| 各种保温时光的背部肌肉供试品营养素质组学(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图2| 各种要在冷藏室保存时间段的腿部肌肉产品的样品地域差异血清剖析(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
表1 铁身亡血清肽的PRM按量探讨(表源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图3| 基本概念KEGG聚集之间的关系体现血清的铁突然死亡逻辑(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 202
PART 02、拜谱个人总结
作者利用TMT定量蛋白质组学鉴定发现15个参与铁死亡调节的DEPs,包含铁离子运输、 Fe2+ 和 Fe3+转化、脂质氧化途径、氧化还原调节和含铁蛋白降解途径。铁死亡依赖于铁离子积累、GPX4失活和脂质过氧化。此外,通过对DEPs的蛋白质和途径相互作用分析,发现了37条代谢途径,通过调节细胞铁超载、细胞膜或细胞器膜脂质氧化和ROS积累来促进铁死亡。铁下垂机制的发现可能为提高牛肉冷藏品质的相关研究提供新的视角,可能有助于预测肉类的潜在质量和鉴定铁下垂的生物标志物。这一过程中拜谱生物制品提供了TMT酶联免疫法蛋白质酶质组学技艺提供产品,拜谱生物水平已研发部门已完成并实现了不断完善早熟的转录组学、蛋白质酶组学、分泌组学包括两组学连合产品技艺提供产品机制,欢迎致电咨询!
考生学术论文:Liu J, Liu D, Hu Z, Hu Y, Yu X. TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration. Food Chem. 2023 Sep 26. doi: 10.1016/j.foodchem.2023.137596.